Široký záběr použití Microboxů má pěstovaní a množení vodních rostlin převážně pro akvaristické účely. Stále oblíbenější je i předpěstování okrasných vodních zahradních rostlin, jako jsou různé kultivary lotosů nebo leknínů.

Micropropagation probíhá nejčastěji na různých výživných gelech (ale např. i na agaru).